Parallel Computing Seminar

Dozent:innen: Univ-Prof. Dr. Bertil Schmidt
Kurzname: 08.079.590
Kurs-Nr.: 08.079.590
Kurstyp: Seminar

Voraussetzungen / Organisatorisches


  1. E-Mail mit 2 bevorzugten Themen (mit Präferenz) an Prof Schmidt bis spätestens 10.7.2026
  2. Ich werde dann versuchen die Themen an Studenten zuzuordnen
  3. Neue Themen können auch vorgeschlagen werden (müssen dann aber von mir genehmigt werden)

Mögliche Themen:

1.cuHPX: GPU-Accelerated Differentiable Spherical Harmonic Transforms on HEALPix Grids
2.Protein database search using PIM architecture
3.RawBench: A Comprehensive Benchmarking Framework for Raw Nanopore Signal Analysis Techniques
4.Algorithm 1061: tsdistances: A High-Performance Python Library for Time Series Distances with GPU Support
5.Squire: A General-Purpose Accelerator to Exploit Fine-Grain Parallelism on Dependency-Bound Kernels
6.A Work-Optimal Parallel Algorithm for Aligning Sequences to Genome Graphs
7.Leveraging Difference Recurrence Relations for High-Performance GPU Genome Alignment
8.Analyzing the performance portability of SYCL across CPUs, GPUs, and hybrid systems with SW sequence alignment
9.Simple, Efficient, and Robust Hash Tables for Join Processing.
10.Hive Hash Table: A Warp-Cooperative, Dynamically Resizable Hash Table for GPUs
11.Endeavor: Efficient PairHMM for Detection of DNA Variants in Genome-Scale Datasets
12.swKokkos: An Athread Backend for Enhanced Kokkos with the Sunway Heterogeneous Architecture
13.Selber vorgeschlagenes Thema (muss aber von mir genehmigt werden)