Bioinformatik Praktikum

Dozent:innen: Dr. Nina Luhmann
Kurzname: 08.079.660
Kurs-Nr.: 08.079.660
Kurstyp: Praktikum (intern)

Voraussetzungen / Organisatorisches

Es ist empfehlenswert, bereits die Veranstaltung "Einführung in die Bioinformatik" gehört zu haben. Programmierkenntnisse in python sind notwendig.

Anwesenheitspflicht

Das Praktikum wird als Blockveranstaltung täglich von 9-17Uhr stattfinden (nein, nicht am Wochenende). Nach Absprache können wir Teile des Praktikums ins home office verlegen (voraussichtlich wird der Vormittag in Präsenz, der Nachmittag im home office stattfinden). 

Inhalt

In diesem Praktikum werden wir uns mit der reproduzierbaren bioinformatischen Analyse von genomischen Daten beschaeftigen. Wir werden dazu verschiedene Hilfsmittel (bash, git, conda, markdown) kennenlernen und anschliessend eine pipeline mit snakemake zur Analyse mehrerer bakterieller Genome implementieren.

Termine

Datum (Wochentag) Zeit Ort
09.03.2026 (Montag) 09:00 - 16:00 04 432
2413 - Neubau Physik/Mathematik
10.03.2026 (Dienstag) 09:00 - 16:00 04 432
2413 - Neubau Physik/Mathematik
11.03.2026 (Mittwoch) 09:00 - 16:00 04 516
2413 - Neubau Physik/Mathematik
12.03.2026 (Donnerstag) 09:00 - 16:00 04 432
2413 - Neubau Physik/Mathematik
13.03.2026 (Freitag) 09:00 - 16:00 04 432
2413 - Neubau Physik/Mathematik
14.03.2026 (Samstag) 09:00 - 16:00 04 432
2413 - Neubau Physik/Mathematik
15.03.2026 (Sonntag) 09:00 - 16:00 04 432
2413 - Neubau Physik/Mathematik
16.03.2026 (Montag) 09:00 - 16:00 04 432
2413 - Neubau Physik/Mathematik
17.03.2026 (Dienstag) 09:00 - 16:00 04 432
2413 - Neubau Physik/Mathematik
18.03.2026 (Mittwoch) 09:00 - 16:00 04 432
2413 - Neubau Physik/Mathematik
19.03.2026 (Donnerstag) 09:00 - 16:00 04 432
2413 - Neubau Physik/Mathematik
20.03.2026 (Freitag) 09:00 - 16:00 04 432
2413 - Neubau Physik/Mathematik