Bioinformatik Praktikum

Dozent:innen: Dr. Nina Luhmann
Kurzname: 08.079.660
Kurs-Nr.: 08.079.660
Kurstyp: Praktikum (intern)

Voraussetzungen / Organisatorisches

Es ist empfehlenswert, bereits die Veranstaltung "Einführung in die Bioinformatik" gehört zu haben. Programmierkenntnisse in python sind notwendig.

Anwesenheitspflicht

Das Praktikum wird als Blockveranstaltung täglich von 9-17Uhr stattfinden (ausgenommen Rosenmontag). Nach Absprache können wir Teile des Praktikums ins home office verlegen.

Inhalt

In diesem Praktikum werden wir uns mit der reproduzierbaren bioinformatischen Analyse von genomischen Daten beschaeftigen. Wir werden dazu verschiedene Hilfsmittel (bash, git, conda, markdown) kennenlernen und anschliessend eine pipeline mit snakemake zur Analyse mehrerer bakterieller Genome implementieren.

Termine

Datum (Wochentag) Zeit Ort
04.03.2025 (Dienstag) 09:00 - 18:00 05 136
2413 - Neubau Physik/Mathematik
05.03.2025 (Mittwoch) 09:00 - 18:00 05 136
2413 - Neubau Physik/Mathematik
06.03.2025 (Donnerstag) 09:00 - 18:00 05 136
2413 - Neubau Physik/Mathematik
07.03.2025 (Freitag) 09:00 - 18:00 05 136
2413 - Neubau Physik/Mathematik
10.03.2025 (Montag) 09:00 - 18:00 05 136
2413 - Neubau Physik/Mathematik
11.03.2025 (Dienstag) 09:00 - 18:00 05 136
2413 - Neubau Physik/Mathematik
12.03.2025 (Mittwoch) 09:00 - 18:00 05 136
2413 - Neubau Physik/Mathematik
13.03.2025 (Donnerstag) 09:00 - 18:00 05 136
2413 - Neubau Physik/Mathematik
14.03.2025 (Freitag) 09:00 - 18:00 05 136
2413 - Neubau Physik/Mathematik